Isolasi DNA Kromosom Salmonella sp. dan Visualisasinya pada Elektroforesis Gel Agarosa

Abstract

Isolasi DNA merupakan salah satu metode dasar dalam biologi molekuler yang dapat digunakan untuk deteksi karakteristik organisme pada ranah molekuler. Setiap organisme memiliki urutan basa nukleotida pada DNA dalam kromosom yang unik. Keunikan tersebut menjadikan DNA sebagai salah satu media untuk deteksi molekuler tertentu. Salmonella sp. merupakan mikroorganisme yang memiliki struktur sel sederhana sehingga materi genetiknya mudah diisolasi. Tujuan penelitian ini adalah untuk memahami teknik isolasi DNA pada Salmonella sp. dan visualisasinya dalam elektroforesis gel agarosa. Metode dimulai dengan isolasi DNA, amplifikasi DNA hasil isolasi dengan Polymerase Chain Reaction (PCR), dan visualisasi pita DNA dengan elektroforesis gel agarosa. Hasil isolasi DNA menunjukkan isolat yang memiliki optical density (OD) cukup baik berkisar di nilai 1,9 μg/ml. DNA hasil isolasi dari kromosom Salmonella sp. membutuhkan amplifikasi dengan PCR sebelum divisualisasi dengan elektroforesis gel agarosa agar jumlah DNA dapat terdeteksi. Optical density (OD) pada kisaran 1,9 μg/ml menunjukkan DNA hasil isolasi yang belum cukup murni dan dimungkinkan masih adanya kontaminasi RNA akibat tidak dilakukan purifikasi.